我再三削弱了地方的军事力量，增强了中央集权的军事控制。自从我建立政权不久，就下令废除郡国都尉这一制度，将兵力统一归属于守卫和行政长官。接着，我又取消了各郡、国的常备军队，并废除了每年一度的都试仪式。从此，地方上的守卫和行政长官失去了他们的军事职能，其部队数量稀少，一般情况下难以进行大规模作战。而对于重大战争，我依赖中央政府所辖的大型军队。

这些中央军队主要分为四支。在首都有两支分别是南方和北方的部队。南方部队又被分为两个部分，其中一个由光禄勋负责管理，有七个中郎将单位：五官中郎将、左中郎将、右中郎将、虎贲中郎将、羽林中郎将以及羽林左监和羽林右监，他们负责宫殿保护与侍从服务；另一个部分由卫尉管理，负责宫门守护。

北方部队设立了一名中候，下分为五个营，即屯骑营、越骑营、步兵营、中水营和射声营，每个营设有一名校尉，对其所属兵力进行管理，并保卫京城。

在地方上，也有两支重要部队。一支位于黎阳（今河南省浚县东），合并了幽州、冀州及并州之兵马，以谒者监作为指挥官。这一任务主要是防御黄河以北地区，为首都雒阳提供北面屏障。一支位于雍（今陕西省凤翔南）的雍营，其任务是保护三辅地区（即左冯翊、大茭风及京兆尹，这些都是西汉皇陵所在地），也是首都雒阳西面的屏障。当时安帝为了抵抗鲜卑贵族的侵扰，又增加了一支渔阳（今北京怀柔）附近驻扎的一批士兵。此外，还包括使匈奴中的匈奴校尉、中郎将度辽、高级校尉护乌桓及护羌校尉等领导边疆驻扎的士兵，这些直属中央政府指挥。