朱元璋，史称“泥腿子皇帝”，在南京巩固了自己的统治地位。他采取了一系列措施来管理官员，并建立了著名的锦衣卫秘密部队。明史学者马渭源指出，明初的官员职责繁重，每个方面都有严格的要求，对于不履行职责的官员，朱元璋绝不手软。

当时，一些酷刑如剥皮、洗肉、抽肠和阉割等被广泛使用。尤其是对大画家倪瓒施加了粪桶刑，这是一种极端残忍的惩罚方式。在那个时代，只要达到一定级别，官员们就能享受标准化住房。马渭源认为，这是朱元璋为了让文武官员能够安心工作，不会腐败所做出的努力。

然而，即便有这样的措施和监视，也有人因贪污而遭到惩罚。当时每位新上任的官员都会接到一份《授职到任须知》，类似现代日记本，用以记录工作情况。而对于那些仍然腐败分子的处理则更为严厉。

最令人震惊的是活剥人皮这种极端惩罚方式，其中一人先被砍下头颅，再从尸体上剥去皮肤，然后将之填满草料，让其像稻草人一样立在衙门前，以此警示后来的官吏贪污后的悲剧结局。此外，还有一种名为锡蛇游的酷刑，它涉及将烧热的锡液倒入犯人的口中直至填满。

宫刑也在这个时代流行，有时候甚至会无辜的人受到牵连，如一个姓李的大臣，他先被开除公职后，因为生活困难竟然将女儿卖出，被发现后遭到了阉割处罚。另一个例子是大画家倪瓒，由于反对朱元璋的一项政策，他逃回了老家，但最终还是被捆绑在粪桶上作为惩罚。这背后的故事表明，即使是在极度残暴的情况下，也可能出现误判与无辜者的案例。