少年时，朱耐根跟随祖父在北京生活，热爱京剧，从谭鑫培那里学到了真传。后来，他以票友的身份，在上海、杭州、汉口、常州等地免费表演，与另一位票友王君直齐名，有“南朱北王”之称。在《京剧音韵概论》中，著名的票友陈小田提到过朱耐根，这证明他是谭派的一位重要人物。苏少卿在《剧评》中赞扬了朱耐根的声音说：“如浮云遮月”，“媲美小余，其传音区区苍劲，更是炉火纯青”。

当年轻时期过去了，朱耐根成了一个中年的大艺术家，以票友的身份居住在上海。那时候，他被尊为“耐二爷”，并且被认为是票界的宗师。他精通谭派唱腔，并曾经在扬州和常州教授学生。在宝应地区，也有许多人学习京剧，他们都受益于朱氏对艺术的深刻理解。

朱耐根还有夫人魏雅兰，她也是个票友。他的唱腔曾被高亭和百代两个公司录制成三张唱片，《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）和《探母回令》（与陈小田合作）。这些唱片因为没有谭鑫培自己录制，所以成为研究谭派声腔艺术非常珍贵的声音资料（现在这三张唱片保存在上海图书馆）。