少年时期的朱耐根与祖父同住在北京，热爱京剧艺术，并得到了谭鑫培的真传。在上海、杭州、汉口、常州等地，他以票友身份免费表演，与另一位票友王君并称“南朱北王”。他的声腔技艺曾被名票陈小田赞誉，甚至入选了《京剧音韵概论》中的谭派名人行列。

中年后，朱耐根定居上海，被票界尊称为“耐二爷”，他是票界的一位宗师。朱氏精通谭派唱腔，在扬州和常州传授技艺。他结拜过多位宝应票友，如居佑申和郭季良，他们都曾与他切磋技艺，并深受其教导。事实上，许多宝应地区的京剧研究者都是受到朱耐根影响的。

朱耐根还有一个特别之处，那就是他的夫人魏雅兰也是一个投身于京剧世界的票友。而他的唱片，也成为了研究谭派声腔艺术不可多得的资料。三张唱片分别是《法场换子》、《梅龙镇》（合作演出）和《探母回令》（与陈小田合作），因为当时谭鑫培没有录制唱片，所以这些作品成为了一份珍贵的声音记录，现在这三张唱片已经保存在上海图书馆。