朱元璋，俗称“泥腿子皇帝”，在南京巩固了自己的统治地位。他采取了一系列措施来管理官员，并建立了所谓的“皇家秘密部队”——锦衣卫。明史学者马渭源指出，明初的官员职责繁重，其衣食住行都有严格规定，对于违规行为，朱元璋从不手软。在他的统治下，一些酷刑如剥皮、洗脑抽肠和阉割等广泛使用，最令人震惊的是对大画家倪瓒的处理，他被施以粪桶刑。

对于达到一定级别的官员，他们可以享用标准宿舍，这是朱元璋为了提供舒适环境，让文武官员能够专心工作而实施的一种策略。当时，锦衣卫会秘密监视这些高级官员，每个上任的官员都会收到一份《授职到任须知》，相当于现代的工作日记，每位官员都必须记录其工作情况。

尽管朱元璋对官员进行了极为严格的管控，但仍然有一些贪腐现象发生，对此，他毫不留情面。最残忍的一种惩罚是活剥人皮，将犯人的头砍掉，然后将皮肤剥离，再在里面放草，使其像稻草人一样立在衙门前作为警示。

除了这种极端惩罚之外，还有其他几种酷刑，如锡蛇游和宫刑。锡蛇游是一种折磨方法，将烧热的锡液倒入犯人的口中；宫刑则涉及身体上的切割和阉割。这两种形式均存在于明朝历史中，其中一个例子涉及到了一个名叫李某的人，被开除后因无以为生而将女儿卖出，只身返回，而遭到了朱元璋的大怒，被迫接受宫刑。

然而，也有一些无辜的人受到了这样的待遇，比如大画家倪瓒。他因为反对朱元璋迁徙富户政策逃回无锡老家，却被捕并遭受了粪桶刑，这背后的原因是由于他坚持洁癖，不愿意与污垢相触。但即便如此，依旧不能逃避那些残酷的手段。