在探讨这个问题之前，我们首先需要明确“世界历史分期三分法”的含义。所谓的“世界历史”，指的是人类社会从起源到现代，跨越数千年、几万年的发展历程。将这段漫长而复杂的历史时间线划分为若干个有机联系相连的时期，是为了便于人们理解和研究。

然而，这种划分并非一成不变，它可以根据不同的标准和角度来进行，比如政治、经济、文化等领域。不过，无论如何划分，都必须基于事实与逻辑，符合史料分析与理论建设的要求。

那么，“科学依据”又具体指什么呢？它可以是以下几个方面：

事实基础：任何一个史学体系都离不开大量的事实资料作为支撑。这些资料包括但不限于文献记载、考古发现以及其他形式的人类活动遗迹。这些事实必须经过严格的验证和分析，以确保其真实性和可靠性。

逻辑推理：基于事实之上，通过逻辑思维对事件进行梳理，并尝试找到规律或模式。这意味着每个时期之间要有一定的转折点或者连续性的关键事件，可以使得这一切看似无序的事情变得有条不紊。

理论构建：根据上述的事实基础和逻辑推理，从中提炼出能够解释现象的一套理论框架。在这个过程中，一定程度上会涉及到哲学思考，因为我们需要考虑如何去理解这些现象，以及它们背后的意义何在。

批判性评估：任何一种划分方法都不可能完美无缺，因此，在接受某种分类方案之前，我们应该对其提出质疑，对已有的观点进行挑战，同时也要准备好接受新的证据或论证。如果新证据出现，它们可能会迫使我们重新审视我们的分类方式甚至整个理论框架。

普遍适用性：一个好的分类方案应当具有较高的一般化水平，即它应该能够适用于多样化的情况，而不是仅仅局限于特定地域或时间段。此外，还应考虑不同地区间相互作用及其对整体发展产生影响的情况。

动态调整：随着新知识、新发现不断涌入，人类对于过去发生过什么以及它们意味着什么也有了更深刻的认识。而这种认识总是在变化，所以我们的分类方法也应当保持一定程度的灵活性以适应未来新的信息输入情况。

综上所述，当我们谈论世界历史三大纪元的时候，其科学依据主要来自于以上六个方面。这并不意味着所有关于此话题的声音都是正确无误，但正如同自然科学一样，只有那些经过严谨检验且能够被广泛认可的事物才是真正值得信赖的地基。