少年时，朱耐根跟随祖父在北京生活，热爱京剧，不仅得到了谭鑫培的真传，还曾以票友身份在上海、杭州、汉口和常州等地免费表演，与另一位票友王君直齐名，有“南朱北王”的美称。他的声腔艺术甚至被提及在陈小田的《京剧音韵概论》中，并列入谭派名人之列。

随着年岁的增长，朱耐根以票友身份定居上海，在当地成为了一位受尊敬的人物，被人们称为“耐二爷”，并视他为票界的一位宗师。他精通谭派唱腔，并且曾在扬州和常州传授技艺。在宝应，他结拜了多位票友，如佑申和郭季良，他们与他切磋技艺，从而受益匪浅。朱耐根的夫人魏雅兰也是一个票友。

他的唱片作品包括《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）和《探母回令》（与陈小田合作），由于谭鑫培没有灌制过唱片，这些作品成为了研究谭派声腔艺术珍贵资料（这些唱片现在保存在上海图书馆）。