学者Cawkwell认为喀罗尼亚战役是古代战史中最决定性的战役之一，此役后希腊城邦再也没有军队可以阻止腓力前进，很快便决定这场战争结果。在雅典和科林斯，记录显示当时人们有意修复城墙，来因应可能来到的攻城战。

然而，腓力二世并没有有意围攻任何城市，也没有想要完全征服希腊城邦，他只是想要希腊人能在他远征波斯时做他的盟友，并确保那时希腊人不会在他远征敌境时，在后方做乱。

此战后，腓力接着朝底比斯进军，底比斯随后向他投降。腓力把底比斯反马其顿的驱除出境，还唤回哪些被驱除的亲马其顿底比斯人回来，他还在底比斯的卫城驻扎一支部队。

除此之外，他还让波奥蒂亚的塞斯比阿（Thespiae）和普拉蒂亚（Thespiae）重建，这些城市在过去的战争中被底比斯人摧毁。大致上腓力对底比斯人相当严厉，他还要底比斯花钱赎回战俘，甚至不愿意主动埋葬战死的底比斯士兵。但腓力并没有解散波奥蒂亚邦联。

相反地，腓力对待雅典非常宽容，尽管解散雅典邦联，但雅典人仍可以保留他们在萨摩斯岛的领地，还有无条件释放战俘。对此腓力的动机不是很清楚，但其中一个可能原因是他希望能在与波斯作战时利用雅典的海军，毕竟马其顿并没有建造强大的海军，因此他需要一个友善的条约来拢络雅典人。

腓力也与其他交战城邦缔结和约，在科林斯和哈尔基斯两地，因为战略位置重要，腓力在此都驻扎部队。接着，腓力转身处理斯巴达问题，虽然斯巴达未在这场战争参战，但似乎斯巴达借着其他城邦衰弱之际，攻击伯罗奔尼撒上附近的城邦。

斯巴达人拒绝与腓力讨论有关议题，因此腓力劫掠西迪莫尼亚（Lacedaemonia）周遭，但他没有攻击斯巴达本城。

腓力似乎在此役后一个月都在希腊四处各地移动，他在那里与其他交战城邦缔约，处理斯巴达，建立驻军。他的行为很可能也像对希腊城邦展示他强大的武力，让他们不敢向自己挑战。

在前337年中，他似乎驻扎在科林斯附近，并准备建立一个包含所有希腊城邦的同盟，他要透过这个同盟保证希腊的和平，并且提供他军事协助来对抗波斯帝国。

结果，腓力二世在前337年后半被成立了科林斯同盟，除了斯巴达以外，所有的希腊城邦都加入这个联盟。

同盟的主要条文中，所有的成员彼此间和马其顿都是盟友，成员中被保证免受攻击的自由、航海自由、免受干涉的自由，而马其顿部队以“和平守护者”的名义驻扎希腊。在腓力的旨意下，若与波斯开战后，全同盟将会举腓力二世为全希腊统帅，率领希腊人作战。

在前336年初期，一支马其顿先头部队送往小亚细亚，准备开战事宜，腓力预定他会在那年年尾率大军展开远征。然而，在他尚未离开希腊时，腓力被他一个护卫刺杀身亡，其子亚历山大大帝继承马其顿王位，并接替他远征的计划，在前334年到前323年间亚历山大征服整个波斯帝国。