在西元4世纪，罗马皇帝君士坦丁为纪念耶稣门徒圣伯多禄的殉道，在罗马城西北角建造了君士坦丁大教堂。15至16世纪，这座建筑物被改造成如今的圣伯多禄大殿，是天主教会举行重大仪式的地方。公元756年，法兰克王国国王丕平将罗马及其周围地区赠予教宗，从而成立了半世俗政体型态的“教宗国”，覆盖意大利半岛中部的大部分地区。

19世纪，欧洲民族主义兴起，意大利统一运动使得梵蒂冈失去了意大利领土。在这种背景下，拿破仑三世以“保护者”之名出兵保护罗马，但普法战争结束后，他撤军，使得意大利王国军队顺利占领罗马城，并完成了国家统一。随后，教宗退居梵蒂冈宫中，与新生的意大利王国关系紧张。

1929年，《拉特兰条约》签订，将梵蒂冈城定为独立主权国家，其领土神圣不可侵犯。这份协议解决了与意大利政府之间长期存在的问题。第二次世界大战期间，梵蒂冈保持中立，并由庇护十二世担任其首脑。

2009年1月1日，梵蒂冈宣布不再自动采纳 意大利议会通过的法律，因为这些法律过于繁杂且与天主教信仰相违背。此外，对于梵蒂冈来说，其官方旗帜和徽章具有深远意义，其中黄白两色代表着金银两种珍贵金属，而红色则象征着过去天主教堂中的最显眼颜色。

至于徽章，则是保禄六世时期所用的图案，它包括了一顶三重冠以及交叉的金黄银白钥匙，以此来表示其作为天上和地上的代表，以及拥有最高权力的象征。而那两把钥匙，则是交给圣彼得的，有着《马太福音》所言：“我要把天国的钥匙给你。”