少年时期随祖父寓居北京，酷爱皮黄，曾得谭鑫培真传。后以票友身份在上海、杭州、汉口、常州等地作过义务性演出。与另一票友王君直齐名，有“南朱北王”之称。名票陈小田在其所著《京剧音韵概论》一书中提到的谭派名人，朱耐根名列其中。

苏少卿在《剧评》中盛赞朱氏的声腔“如浮云遮月”，“媲美小余，其传音区区苍劲，更是炉火纯青”。

朱耐根中年以后，以票友身份寓居上海，上海票界时称他为“耐二爷”，并尊为票界宗师。他精擅谭派唱腔，并曾在扬州、常州传艺。在他的影响下，不少宝应地区的研究者学习了京剧艺术。

他的夫人魏雅兰也是一位票友，他们合作录制了多张唱片，其中包括《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）和《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些唱片是由高亭、高百代两家公司灌制，因此成为研究谭派声腔艺术极为珍贵的声音资料（目前这三张唱片存放在上海图书馆）。

此外，这些历史性的声音资料对于理解当时京剧发展的情况具有重要意义，对于后来的戏曲教育和文化研究同样具有深远的价值。